工程预算阶段是工程造价审计把关的重要阶段，其主要工作是对工程竣工结算的审核。该项工作，主要是由工程审核人员根据合同、相关定额、竣工资料、 或地方的有关法规法规为依据，对送审的竣工结算进行汇总核实。工程决算的审核，核准的难点之一是工程项目隐蔽工程的签证。当前工程项目隐蔽工程签证，在审核的工程造价中，占有较大比重。隐蔽工程，由于施工后已难再见，无法实物核查，而终的审计人员只有依据相关资料及签证。
工程预算计价依据的主要作用
1)计算分析工程预算的重要依据；
2)投资决策和工程决策的重要依据；
3)促进施工企业、生产企业技术进步，降低社会平均必要劳动量；
4)政府对工程建设进行宏观调控，对资源配置进行预测和平衡的重要依据；
5)是各类造价信息反映工程建设经济活动的重要依据。
签证基本原则
1、对发生特殊情况并且不是由于施工单位原因造成的工程内容及工程量的增加，可以现场签证；
2、工程施工过程中如遇图纸不善或图纸错误，对需要变更的工作内容按设计变更程序，不进行现场签证。但对由此引起前工序的返工修改内容可进行签证确认
工程预算政府投资项目结算中的高估冒算还比较普遍， “三超”现象严重 ，通过重点抽查审计，可以发现并纠正大量违法乱纪行为，从总体上有效遏制超计划投资，节约大量的政府财政资金。这种方法的优点是审计时间短、风险小、效果好，适合对标底、专项预算和工程量清单的审计。例如，在某工程预算进行审计时，发现程项目很多，投资较大 ，如要对每个项目都进行审计，将要耗费大量的时间和精力。针对这一情况 ，审计人员在制定审计实施方案时 ，决定采用重点抽查法进行本次工程预算审计。经排查 ，发现天花进口矿棉板报价80 元/ m2，这个价格比市场上同类产品高出许多。
工程预算以竣工图纸为依据，审定工程预算的一种方法。基建工程决算审计，必须认真仔细地看清所有的竣工图纸，才能全面准确无误地计算审定工程预算的真实性。要求审计人员必须熟练掌握所有的建施图、结施图、水暖电平面图、系统图；不仅要将每一张图纸看懂吃透，而且要将所有的图纸综合分析。结合工程竣工资料、设计变更及相应的工程签证，综合会诊才能发现问题、揭露问题。看图法是基建工程决算审计基本、普遍、直观、常用的方法，它贯穿基建工程决算审计的全过程。